Uzm. Dt. Burç Pekpınarlı, Ege Üniversitesi Diş Hekimliği Fakültesi'nden mezun olduktan sonra, aynı üniversitede Pedodonti (Çocuk Diş Hekimliği) alanında uzmanlık eğitimine başlamıştır. Bu dönemde, çocuklarda ağız ve diş sağlığını koruyucu uygulamalar ile süt dişleri ve genç daimi dişlerin tedavisi üzerine çalışmalar yapmıştır. Uzmanlık eğitimi boyunca Ege Üniversitesi pedodonti kliniğinde, farklı yaş gruplarındaki çocuklarda diş çürükleri, travmalar ve diğer diş sağlığı sorunları üzerine vaka çalışmaları yürütmüştür.
Akademik ilgisini en çok çeken alanlardan biri rejeneratif endodonti idi. Kalıcı dişlerin gelişimi üzerine yaptığı araştırmalarda, tedavi sonuçları üzerinde kalsiyum hidroksit ve antibiyotik karışımlarının etkilerini inceledi. Bu konuda yaptığı bir çalışma, Journal of Applied Oral Science dergisinde yayımlandı. Ayrıca, İzmir'deki okul öncesi çocuklarda diş çürümesi ve malokluzyonun yaşam kalitesine etkisini değerlendiren bir çalışmanın ortak yazarıydı. Bu çalışmanın bulguları, çocukların ağız sağlığının okul performanslarını ve sosyal etkileşimlerini nasıl etkilediğini ortaya koydu.
Uzmanlık eğitimini tamamladıktan sonra Manisa'da bir ağız ve diş sağlığı merkezinde pedodonti uzmanı olarak çalıştı. Daha sonra İzmir'deki CEON Ağız ve Diş Sağlığı Polikliniği ekibine katıldı. Bu süre zarfında, konjenital nötropeni gibi özel durumları olan pediyatrik hastalarla çalıştı ve çeşitli proteomik çalışmalara katkıda bulundu. Önleyici diş hekimliği uygulamalarından rejeneratif prosedürlere kadar geniş bir yelpazede çalışmalarını sürdürdü. Klinik çalışmalarının yanı sıra, yerel belediyeler tarafından düzenlenen etkinliklerde çocuklara diş fırçalama ve ağız bakımı konularında pratik eğitim verdi. Bu faaliyetler, toplumda çocukların diş sağlığı hakkında farkındalık yaratma çabaları olarak hizmet etti.